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Unnamed: 0 A1 beta file maf p-value rsid snps source type snp_noallele found proxy_snp proxy_variant chr cis tss ukbb cancer_gwas vanderbilt survival icb risk_melanoma risk_prostate risk_either OS PFS OS_PFS icb_filt OS_BLCA OS_BRCA OS_COAD OS_ESCA OS_HNSC OS_KICH OS_KIRC OS_KIRP OS_LIHC OS_LUAD OS_LUSC OS_PAAD OS_READ OS_SKCM OS_STAD PFS_BLCA PFS_BRCA PFS_COAD PFS_ESCA PFS_HNSC PFS_KICH PFS_KIRC PFS_KIRP PFS_LIHC PFS_LUAD PFS_LUSC PFS_PAAD PFS_READ PFS_SKCM PFS_STAD ieqtl dice VEP_TranscriptionFactor VEP_NMD VEP_noncoding VEP_splice
0 0 A 0.280842 HAUS1 0.05038 1.6200000000000004e-13 rs72903445 18:43682273:G:A discovery 18:43682273 found rs72903445 18:43682273:G:A 18 2024.0 no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no
1 1 G 0.301816 HAUS1 0.0261 7.85e-09 rs12962856 18:43639384:T:G discovery 18:43639384 found rs12962856 18:43639384:T:G 18 44913.0 ukbb no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no yes no
2 2 C 0.0927561 HAUS1 0.4901 3.0499999999999995e-08 rs12954742 18:43703223:G:C discovery 18:43703223 found rs12954742 18:43703223:G:C 18 -18926.0 ukbb no no survival no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no yes no no
3 3 C 0.128377 AMPD3 0.4596 1.18e-14 rs10840420 11:10490415:T:C discovery 11:10490415 found rs10840420 11:10490415:T:C 11 -18192.0 ukbb no no survival no no no no yes yes yes no no no no no no yes yes no no no no no no no no no no no no no yes no no no no no no no no yes no yes no no
4 4 C -0.12392 AMPD3 0.3557 9.33e-13 rs7130140 11:10489826:A:C discovery 11:10489826 found rs7130140 11:10489826:A:C 11 -17603.0 ukbb no no survival no no no no yes no yes no no no no no no no no no yes no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no yes no no
5 5 A -0.0965715 AMPD3 0.4039 1.29e-08 rs6484291 11:10471738:G:A discovery 11:10471738 found rs6484291 11:10471738:G:A 11 485.0 no no no survival no no no no yes yes yes no no no no no no no yes no no no no no no no no no no no no no no no yes no no no no no no no DC no no yes no
6 6 T 0.1084609999999999 AMPD3 0.2545 1.58e-08 rs10840419 11:10486254:C:T discovery 11:10486254 found rs10840419 11:10486254:C:T 11 -14031.0 ukbb no no survival no no yes yes no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no yes no no
7 7 T -0.118863 AMPD3 0.1718 5.35e-08 rs6484302 11:10488875:C:T discovery 11:10488875 found rs6484302 11:10488875:C:T 11 -16652.0 ukbb no no survival no no yes yes no yes yes no no no no no no no no no no no no no no no no yes no no no no no no no no no no no no no no no yes no no
8 8 T -0.6191949999999999 OAS3 0.0129 1.81e-17 rs61942233 12:113403675:C:T discovery 12:113403675 found rs61942233 12:113403675:C:T 12 -27427.0 ukbb no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no yes no
9 9 A -0.107875 OAS3 0.3672 4.35e-10 rs4767037 12:113372804:C:A discovery 12:113372804 found rs4767037 12:113372804:C:A 12 3444.0 ukbb no no survival no no no no yes no yes no no yes no no no yes no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no CD8+ T cells no no yes no
10 10 G 0.124497 RNF41 0.1666 2.1e-08 rs6468360 8:29743994:C:G discovery 8:29743994 found rs6468360 8:29743994:C:G 8 ukbb no no survival no no no no yes no yes no no no no yes no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no yes no
11 11 A -0.185943 TCEB1 0.07089 8.95e-09 rs62297985 4:55442830:G:A discovery 4:55442830 found rs62297985 4:55442830:G:A 4 no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no no
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